崇祯皇帝的怒火，一旦被点燃，便如燎原之火，迅速席卷了整个京师。关于毒杀太医、图谋刺驾的调查结果（无论其是否完全属实），以及那场发生在承门外的对抗，都成了他彻底清洗朝堂、巩固权力的最佳借口。
冰冷的谕旨，一道接一道地从深宫发出，带着不容置疑的杀伐之气：
“罪妇李氏，原封康妃，久居冷宫，不思悔改，反暗中勾结其弟李善财及朝中逆臣，毒杀太医，图谋弑君，罪大恶极！着……即刻废黜其所有封号，于冷宫内赐三尺白绫，自尽！其父家、母家、妻家（若有）三族以内，凡在京者，一体处斩！在外者，着地方官府一体擒拿正法！”
“罪臣郑三俊，原任吏部尚书、内阁大学士，身为官首辅（指其吏部尚书之职），本应忠心王事，辅佐朕躬，却包藏祸心，与李氏逆党、陈演逆党暗中勾结，图谋不轨，罪在不赦！着……将其夷平十族！明日午时三刻，押赴西市菜口，明正典刑，以儆效尤！其妻女……贬入教坊司，永世为奴！”
“此二案，由锦衣卫、东厂、内行厂、刑部、大理寺联合执行！即刻查抄其家产，所有田契、商铺、金银、古玩、字画，尽数封存，点算入库！有敢于阻挠、藏匿人犯或财物者，以同罪论处！”
圣旨一下，京师震动！株连九族！夷平十族！赐死皇妃！斩杀官！这一连串酷烈无情的判决，让所有人都感受到了皇帝那不留丝毫余地的铁血决心！
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旨意传出，厂卫率先而动！
东厂番役在承门外大开杀戒的余威尚在，新设的内行厂番役和整肃后的锦衣卫缇骑，便如同出鞘的利刃，兵分两路，从东华门、西华门鱼贯而出，直扑郑三俊府邸和李氏在京亲族的各处宅院。西厂提督曹化淳麾下的掌刑千户，也领了一队人马，向刚刚入阁的冯铨和东厂提督王承恩行礼报备后，迅速加入了这场遍及全城的抓捕与抄家行动之郑锦衣卫指挥使李若链更是亲自坐镇北镇抚司，调兵遣将，部署着这场规模浩大的抓捕行动，务求将所影逆党”一网打尽。
相比于厂卫的雷厉风行，刑部和大理寺这两个传统的司法衙门，则显得异常尴尬和被动。接到协同办差的圣旨，两衙门的高层官员——其中大多与东林党有着千丝万缕的联系，甚至对郑三俊颇为敬重——心中又惊又惧，却又不敢公然抗旨。最终，他们只能采取了象征性的配合，各自派遣了少量品级低下、无甚背景的衙役和书吏，跟在厂卫后面“协助”登记、搬运财物，将这趟注定要背负骂名的差事，甩给了那些无关紧要的边缘人物。
崇祯对此心知肚明，却也乐见其成。正好借此机会，绕开那些盘根错节的高层官员，直接与这些渴望上爬、却苦无门路的底层吏员建立联系，施以恩惠，将他们收为己用。
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就在京城因大肆抓捕而陷入一片混乱之时，坤宁宫内，周皇后也得知了皇帝对李康妃和郑三俊的最终处置。当听到“九族”、“十族”这些字眼时，她惊愕得几乎站立不稳！她可以理解皇帝对叛逆者的愤怒，但如此酷烈的株连，甚至要赐死一位先帝的妃嫔（尽管已被打入冷宫），这……这实在是有违人伦，也大大超出了她的想象！
“不行！本宫要去见陛下！至少……至少要为那些无辜的妇孺求情！” 她心中只有一个念头，不顾宫女的劝阻，便急匆匆地朝着冷宫的方向走去，希望能赶在旨意送达之前，做最后的努力。
然而，在通往冷宫的宫道上，她却迎面遇上了一队由方正化亲自带领的内行厂番役，正押解着披头散发、哭哭啼啼的李康妃（西李）往外走！
“住手！” 周皇后厉声呵止，拦在了队伍前面。
那李康妃见到皇后，如同见到了救星，立刻乒在地，抱着皇后的腿哀哭求救：“皇后娘娘！救救臣妾！臣妾冤枉啊！陛下……陛下要杀臣妾！求娘娘看在同为姐妹的份上，在陛下面前替臣妾求求情吧！”
方正化见状，眉头一皱，示意手下番役上前，想要将李康妃拉开，继续押解。
“放肆！” 周皇后凤目圆睁，猛地上前一步，竟扬手给了方正化一个响亮的耳光！“方正化！你好大的胆子！竟敢在本宫面前，对皇贵妃（她有意提高了称呼）动粗？！谁给你的权力？！”
方正化捂着脸，又惊又怒，却不敢发作，只能躬身道：“奴才不敢！奴才是奉……奉陛下旨意……”
“陛下的旨意？” 周皇后冷笑一声，抓住了她认为的关键点，“陛下的旨意，可曾经过内阁票拟？可有内阁辅臣副署？没有票拟副署，便只是中旨！按祖制，中旨岂能用来废黜、赐死皇妃？！你身为司礼监大珰，难道连这点规矩都不懂吗？！” 她试图用传统的制度，来阻止这场在她看来过于残酷的行动。
就在两人争执不下之际，一个冰冷的声音传来：“朕的旨意，何时需要经过内阁票拟了？”
崇祯皇帝不知何时，竟已在王承恩和几名侍卫的簇拥下，亲临现场！
“陛下！” 周皇后连忙屈膝行礼。方正化和所有番役更是立刻跪伏在地。
崇祯看都没看皇后一眼，反而上前一步，亲自扶起了方正化，脸上竟带着一丝嘉许的微笑：“方伴伴忠心耿耿，奉旨办事，何罪之有？来人，” 他对着身后一名侍卫道，“将朕昨日新得的那件云锦蟒袍，赐予方伴伴！”
方正化受宠若惊，连忙叩谢皇恩。周皇后看着这一幕，心中疑惑不解，更感一阵屈辱和不安。
崇祯这才转向皇后，语气平淡却带着不容置疑的威严：“梓童，你不必再多言。赐死李氏，诛杀郑三俊及其族人，所有旨意，皆由朕亲口下达，亲笔批红！方正化他们，只是奉旨行事，罪责不在他们，而在朕！”
他顿了顿，目光扫过在场的所有人，声音陡然提高：“朕今日便在此，将话个明白！朕已经看透了！这满朝文官，所谓的内阁票拟，所谓的科道封驳，不过是他们用来掣肘君权、推诿塞责、结党营私的工具！朕再也不会受他们的摆布！”
“传朕旨意！” 他的声音响彻宫道，如同惊雷，“自今日起，废除内阁票拟之权！此后，凡朕所下达之任何谕旨、敕令，无论是否经过内阁，无论是否有辅臣副署，皆为大明圣旨！颁布即刻生效！有敢质疑、拖延、拒不执行者，一律以欺君罔上、图谋不轨论处！格杀勿论！钦此！”
这番话，无异于一场政治上的地震！废除票拟！这意味着明朝立国以来，文官集团赖以制衡皇权的最重要的一道程序，被彻底废除了！
崇祯站在那里，目光冷冽地环视着因震惊而鸦雀无声的众人，心中充满了决绝。“从今起！” 他在心中对自己，“皇帝之命，便是命！朕的话，就是这大明的法！朕将以一人之意志，乾纲独断，扫除一切障碍！朕要让所有人都知道，谁，才是这个帝国真正的主人！”
一场围绕着皇权与相权、祖制与现实的终极较量，以崇祯皇帝近乎粗暴的方式，宣告了他的最终胜利。但胜利的背后，是流血，是恐惧，是整个统治体系根基的动摇。这独断的皇权，会将大明引向何方？
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